| セッション情報 |
ポスターセッション(肝臓学会)
C型肝炎-基礎1
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| タイトル |
肝P-34：次世代シークエンサーを用いた発癌群と非発癌群におけるHCV coreアミノ酸変異の経時的変化
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| 演者 |
飯尾 悦子（名古屋市立大大学院・消化器・代謝内科学DELIMITER名古屋市立大大学院・ウイルス学） |
| 共同演者 |
村上 周子（名古屋市立大大学院・ウイルス学）, 渡邊 綱正（名古屋市立大大学院・ウイルス学）, 松居 剛志（名古屋市立大大学院・ウイルス学）, 渡辺 久剛（山形大・消化器内科）, 斎藤 貴史（山形大・消化器内科）, 野尻 俊輔（名古屋市立大大学院・消化器・代謝内科学）, 城 卓志（名古屋市立大大学院・消化器・代謝内科学）, 田中 靖人（名古屋市立大大学院・ウイルス学） |
| 抄録 |
【目的】近年，C型肝炎ウイルス(HCV)core70変異の蓄積と肝発癌との関連が指摘されている．今回我々は次世代シークエンサー（NGS）を用いて，HCV患者のcore70変異を，発癌群と非発癌群で経時的変化を解析し，従来のDirect sequencing（DS）法と比較検討した．【対象・方法】C型肝炎住民コホート研究HCV-1b 20名（観察期間中の発癌群，非発癌群各10名）を対象とし，core70/91を含むcore領域274塩基配列（nt 348-622）において，NGS (Genome Sequencer FLX (Roche))を用いてDSの結果と比較検討．IL28Bなどの臨床データと合わせて解析．【成績】発癌群，非発癌群各10症例のNGS解析を行い，検出された総リード数，総塩基数の各中央値は1560 (158-8552)，488,828 (22,339-2,602,301)で，reference HCV-Jにマッピングされたread数中央値は1376であった．年齢中央値，性別(M/F），IL28B多型 (Major/HE/Minor)，観察期間中央値(月)は，発癌群 : 非発癌群= 63.5 (50-73) : 60.5 (52-72)，5/5 : 4/6 ，6/3/1 : 8/2/0 ，120.5 (41-181) : 108 (72-192)で，いずれも両群間に有意差を認めなかった．core70はエントリー時，DSでは発癌群，非発癌群で，野生型(W)/変異型(M)＝3/7：6/4で，発癌群で多い傾向であった．また経時的変化は，W→W：W→M：M→M：M→Wが発癌群1 : 2 : 6 : 1，非発癌群4 : 2 : 4 : 0であった．IL28B多型別では，発癌群のHE3例は1例W→M，2例M→Mと発癌時に変異型で，Minorの1例はM→Wに変化した．NGSでは，発癌群2例，非発癌群5例でminor cloneを検出したが，DSで野生型と変異型の混在を検出できたのは各群1例であった．エントリー時DSで単一cloneの3例は，NGSでminor clone が2.6，3.5，8.9％混在していた．【結論】NGSはDSで検出できなかったCore70のquasispieciesを検出できた．解析症例及びポイントを増やして追加検討する． |
| 索引用語 |
次世代シークエンサー, core70 |
