| セッション情報 | 口演肝癌 基礎 |
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| タイトル | O-155：次世代シークエンサーによる肝発癌に関与するmiRNAの網羅的解析 |
| 演者 | 村上 善基（大阪市立大学肝胆膵内科） |
| 共同演者 | 棚橋 俊仁（神戸薬科大学）, 田口 善弘（中央大学理工学部）, 豊田 秀徳（大垣市民病院消化器内科）, 熊田 卓（大垣市民病院消化器内科）, 榎本 大（大阪市立大学肝胆膵内科）, 田守 昭博（大阪市立大学肝胆膵内科）, 河田 則文（大阪市立大学肝胆膵内科） |
| 抄録 | 【目的】マイクロRNA（miRNA）は生体反応，恒常性の維持に大きな役割を果たしており，その発現異常は疾患と深く関係している．網羅的なmiRNAの発現解析は主にmicroarrayを用いて行われているが，次世代シークエンサー（NGS）とmicroarrayのmiRNAの発現解析能力を肝細胞癌（HCC）について比較した．【方法】14例のHCCとその周辺非癌部6例よりtotal RNAを抽出しアダプター配列を付加したcDNAに変換し，Illumina社MiSeqを用い50塩基配列毎に解析を行った．NGSのデータはmiRdeep2を用いて解析した．同一検体をAgilent社のhuman microRNA microarray（Rel 14.0）を用いてデータ収集を行いその結果をGeneSpringにて解析を行った．【成績】NGSは平均220万リードを得，ヒト遺伝子の約57%をカバーした．10例のHCCにおけるNGSとmicroarrayの比較は以下のようになった．平均correlation logarithmic indexは0.613，subtraction of correlation logarithmic indexは0.587であった．NGSにおけるmiRNA発現解析の再現性は0.976と高い値を示した．非癌部における8種のmiRNAs（miR-10a-5p，miR-122-5p，miR-146b-5p，miR-148a-3p，miR-192-5p，miR-22-3p，miR-26a-5p，and miR-27b-3p）の発現は癌部より有意に発現が高かった．また非癌部における3種のmiRNAs（miR-10b-5p，miR-143-3p，miR-21-5p）の発現は癌部に比べ有意に低かった．NGSにおけるHCCの診断能はそれぞれaccuracy=90.0%，p-value=7.442E-04，AUC=0.92であった．さらにNGS解析では新たなmiRNA候補が検出された．【結論】microarray解析はversionが異なると互換性が取れなく，別の方法で結果を検証する必要があった．NGS解析は再現性が高く，microarray解析との相関も高く，経年的に解析した結果を比較することが可能であった．さらにNGS解析は新規miRNAの検出を行うことも可能であり，non coding RNA発現解析に有用であると考えられた． |
| 索引用語 |